Wissenschaftliches Rechnen bei iDiv
Die computergestützte Auswertung großer Datensätze spielt heutzutage eine zunehmende Rolle in der Wissenschaft. Um diesen rechenintensiven Anforderungen gerecht zu werden, stellt iDiv neben technischen Ressourcen auch ein hohes Maß an Unterstützung zur Verfügung, um diese Ressourcen optimal zu nutzen. Gemeinsam mit den Nutzern wird eine angemessene Plattform für die Forschungsprojekte ausgewählt, damit Arbeitsabläufe verbessert und an neue Anforderungen angepasst werden können. Dabei ist es egal, ob die Plattform der eigene Computer, ein Terminal Server oder das HPC Cluster ist.
Mit Unterstützung der Scientific Computing Services können Arbeitsabläufe im wissenschaftlichen Rechnen verbessert werden!
RStudio Server
Die RStudio Server sind über den Web Browser erreichbare Server, die Zugang zur RStudio Web IDE (integrierte Entwicklungsumgebung – „Integrated Development Environment“) anbieten. Um die RStudio Server zu nutzen, muss auf dem Endgerät nichts installiert werden. Die Server können von überall aus genutzt werden. Diese Plattform ist für interaktives Arbeiten und mittelgroße Berechnungen geeignet.
Terminal Server
Die MS Windows Terminal Server ermöglichen den Zugriff zu Software, die nur unter Windows läuft, z.B. ArcGIS Desktop. Mittels RDP (“Remoted Desktop Protocol“) ist eine Anmeldung auf diesen Servern möglich. Diese Plattform ist für interaktives Arbeiten und mittelgroße Berechnungen geeignet.
HPC-Cluster
Das HPC-Cluster bietet Zugriff zu praktisch jeder Software, die auf Linux lauffähig ist. Eine hohe Anzahl an Jobs kann an das Cluster abgeschickt werden. Diese Jobs bekommen über Zeit von einem Scheduler Ressourcen zugewiesen und werden damit vollkommen automatisch abgearbeitet. Diese Plattform ermöglicht den höchsten Grad an Automatisierung und eignet sich für die größten Berechnungen, hinsichtlich Rechenleistung, Arbeitsspeicher, Festplattenspeicher und Zeit.
Ressourcen
| RStudio Server | Terminal Server | HPC-Cluster | |
|---|---|---|---|
| Prozessoren | ~ 24 | ~ 50 | ~ 2.300 |
| Arbeitsspeicher | ~ 280 GB | ~ 600 GB | ~ 27 TB |
| Festplattenspeicher | ~ 5 TB | ~ 35 TB | ~ 2,5 Petabyte |
SCaaS – Scientific Computing as a Service
Selbst ohne Erfahrung im wissenschaftlichen Rechnen, können die anfängerfreundlichen Dienstleistungen bei iDiv in Anspruch genommen werden. Während der Entwicklung von einsatzbereiten Werkzeugen zur Analyse von Daten wird eine einfache Einleitung in die Methoden des wissenschaftlichen Rechnens angeboten.
Schulungen
Die Grundlagen des wissenschaftlichen Rechnens werden in Schulungen vermittelt. Das gewonnene Wissen kann in praxis-orientierten persönlichen Beratungen vertieft werden.
Themen
Themen schließen ein, sind aber nicht beschränkt auf:
- Einleitung zum High-Performance Computing
Lernen, worum es beim Hochleistungsrechnen wirklich geht. - Versionskontrolle und Zusammenarbeit mit git
Lernen, wie man Programmcode und wissenschaftliche Arbeiten mit dem Versionskontrollsystem git verwaltet und die Zusammenarbeit auf ein Niveau über MS-Word-Kommentare hebt. - Linux, die Kommandozeile und Shell Scripting
Lernen, wie man Linux und dessen mächtige und flexible Schnittstelle – die Kommandozeile – nutzt. - Reproduzierbarkeit
Lernen, wie Reproduzierbarkeit direkt in deine Arbeitsabläufe integriert werden kann.
Persönliche Beratung
In den praxisorientierten, persönlichen Beratungen werden einzelne Themen tiefer gehend behandelt. Diese Beratungen sind bestens dafür geeignet, Lösungen für konkrete Probleme zu finden und Wissen in einem spezifischem Bereich des wissenschaftlichen Rechnens zu vertiefen.
Themen
Themen schließen ein, sind aber nicht beschränkt auf:
- Arbeitsabläufe
Entwicklung von Pipelines
Portabilität
Automatisches Validieren / Verifizieren von Ergebnissen
Reproduzierbarkeit - Datenmanagement
Beschaffung
Archivierung - Projektverwaltung
Git
Software-Testing - Performance-Analyse
Monitoring
Debugging - Software-Design und -Entwicklung
Optimierung
Parallelisierung
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